巴士
路线众多而复杂，大多以铁路车站或重要地点为端点站或主要换乘站，主要街道上也经常可见巴士站牌;都心部的市区巴士以都营路线为主，兼有里程较长路线与短程接驳路线(如涩谷站～六本木新城)，以及几条观光巴士路线(如东京、银座～台场)。都心以外的地区巴士多由私铁业者(东武、西武、东急等)兼营，因此经常以私铁车站作为端点站。另外还有往返于都心部主要饭店、东京机场巴士总站(T-CAT)与成田机场、羽田机场间的“AirportLimousine”(利木津巴士)。在几个大型转运站(东京站、新宿站…等)附近，也有数条长途高速巴士路线，可以搭乘前往本州岛各地。
出租车
在铁路车站附近与主要街道上可以找到出租车站，而且原则上可以在任何地方搭乘出租车。当出租车前挡风玻璃左下角的信号灯显示为红色时，则表示这辆出租车可以搭乘。乘车时，司机会自动(车上的一个按钮)把后门打开，上车后司机自动关门。到达目的地后，按照计价器付钱，司机自动把车门打开，乘客下车，不用关门。
电车
新交通百合鸥号(新交通ゆりかもめ)，无人驾驶电车路线，连接新桥、汐留、台场(临海副都心)与丰洲。
单轨铁路
东京单轨电车(东京モノレ`ル)，连接东京国际机场(羽田机场)和市区(滨松町)。
多摩都市单轨电车(多摩都市モノレ`ル)，位于东京西边的多摩地区。
迪士尼渡假区线(ディズニ`リゾ`トライン)，连接迪士尼乐园与迪士尼海洋乐园(单向环状运行路线)。
地铁
各路线都有专属的英文字母代号，主要是与数字组合，作为各路线车站的快速辨识代号(例如东京站西北方地下的大型转乘站-大手町站，是丸之内线与东西线的交会点，它分别为丸之内本线编号第18站，与东西线编号第9站，因此有“M18”与“T09”两个代号)。至于专属路线代表色，则是与车站内的导引指标用色，以及地下铁车厢上的彩色装饰线条配合，方便搭乘民众辨识。
银座线G=橘色
丸之内线M(支线代号为m)=红色
日比谷线H=银色
东西线T=蓝色
千代田线C=绿色
有乐町线Y=金色
半藏门线Z=紫色
南北线N=翠绿色
副都心线F=棕色
