飞机
库斯科机场位于库斯科市东南方向两公里处，但由于机场较小，游客却很多，所以异常的繁忙。这里的国际航空线路很少，一般中国游客需要先到达首都利马市，再从利马市飞往库斯科。
由库斯科市中心的武器广场前往飞机场出租车的价格一般不会超过15索尔，游客在与司机议价时应注意。
在库斯科机场有多家航空公司的航班可以飞往秘鲁其他城市，其中LAN航空、TACA航空、Star Peru航空非常知名。
火车
库斯科的铁路线路并不发达，总体来说只有从库斯科市前往普诺和马丘比丘两个方向的路线。但是由于游客众多，因此火车票十分紧张，游客需要提前购票，以免耽误行程。
圣佩德罗火车站
这里运营着开往马丘比丘的列车，火车站位于武器广场附近。
万查科火车站
这里负责开往胡利亚卡和普诺方向的列车，位于市区El Sol大街。
客车
库斯科市到秘鲁其他城市的长途汽车很多，都集中在市区南部的长途汽车站。这里有前往普诺（7小时，约45索尔）、阿雷基帕（10小时，约80索尔）、利马（22小时，约160索尔）等地的客车，沿途的风景很好，但是长时间的旅途会令游客感到疲倦。
公交
库斯科市内的公交车价格合理，票价不到1索尔。车型一般都是小型巴士，乘坐公交车可以更加贴近秘鲁当地的生活。
出租车
在库斯科市区内出租车非常多，而且是大多数游客的首要选择，因为库斯科市区内的各个景点比较近，乘坐出租车价格基本在5索尔以内。
短途巴士
来到库斯科市的游客大多会以库斯科为中心到周边的小镇或遗迹去看一看，市内的短途巴士方便了游客的出行。短途巴士可以前往皮萨克（1小时，3.5索尔）、乌鲁班巴（2小时，4索尔）、钦切罗（50分钟，2.5索尔）等地，基本上全天都会通车。
